胃能分泌一系列的酶来分解蛋白质，我们把这些酶统称为蛋白酶。蛋白质的消化在小肠的第一部分——十二指肠中继续进行。胰脏和肝脏分泌的消化酶在这里汇集。胰脏是主要的消化器官，它的特殊细胞可以分泌消化酶来分解碳水化合物、脂肪以及蛋白质。我们把这些酶称作淀粉酶、脂肪酶及蛋白酶。自然它们也包含有很多不同的种类。
消化酶的产生取决于许多微量营养物质，尤其是维生素B6。营养不良通常造成消化不良，随之而来的是吸收不良，久而久之营养物质的摄入就会变得越来越差。结果是未消化的食物淤积在小肠里，从而刺激了错误种类的细菌和微生物的繁殖。由此引起的症状包括肠胃气胀，腹痛以及肿胀。
对付这一类问题最简单的方法是在吃每顿饭时服用含有各种消化酶的增补剂。这种方法可谓是立竿见影。如果你想检验一下消化酶增补剂的功效到底怎样，不妨做一下下面这个简单的试验：将你的消化酶增补剂捣碎后撒人一碗浓稠的麦片粥，假如这些药物质量可靠，那碗粥会在30分钟之内变成稀释的液体。坚持服用消化酶对身体没有什么害处，而不时的服用一些增补剂来控制各种消化酶的含量则有助于增加体内营养物质的含量。一旦做到了这一点，消化系统通常可以进行自我改善，慢慢地我们也就不需要服用那些消化酶增补剂了。
在被全部消化之前，脂肪需要经过特殊的加工过程。这道工序由一种叫做胆汁的物质完成，它是由肝脏分泌的，并在胆囊中存储。胆汁中含有蛋黄素，它能够乳化大块的脂肪颗粒并把它们变成小的微粒。这样一来，脂肪酶就有了一个更大的工作空间。粒剂或胶囊状的蛋黄素增补剂有助于提高人们的乳化功能。而且它还能帮助那些对脂肪的耐受性较差的人们，如切除了胆囊的人，由于他们自己不能储存胆汁，因此也就无法很好的消化脂肪。
